16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2899 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  680    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  80.18 
 
 		 372 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  64.18 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0402  hypothetical protein  37.5 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  35.33 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  20.56 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  23.31 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  22.45 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  23.77 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  23.55 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  33.7 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  22.14 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1681  protein of unknown function DUF481  25.38 
 
 		 419 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  27.78 
 
 		 246 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  32.61 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>