85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0880 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  90.24 
 
 		 246 aa  420  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  84.96 
 
 		 246 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  71.95 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  71.14 
 
 		 245 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  71.14 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  71.14 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  69.51 
 
 		 245 aa  358  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  69.51 
 
 		 245 aa  358  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  69.92 
 
 		 245 aa  358  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  69.51 
 
 		 245 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  69.11 
 
 		 245 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  71.14 
 
 		 246 aa  349  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  66.26 
 
 		 246 aa  348  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  72.69 
 
 		 247 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  61.79 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  36.33 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  34.41 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  34.46 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204125  hitchhiker  0.000000158177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  35.02 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  29.96 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  30.65 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1233  hypothetical protein  33.96 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3877  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03211  putative salt-induced outer membrane protein  29.52 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000342266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  30.66 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3357  putative salt-induced outer membrane protein  26.94 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3352  hypothetical protein  27.6 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000185649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0700  hypothetical protein  27.13 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000147849  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3644  hypothetical protein  28.16 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0752  hypothetical protein  26.32 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00298481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0731  protein of unknown function DUF481  28.16 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000132441  hitchhiker  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0740  hypothetical protein  28.16 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000500329  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3261  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014751  hitchhiker  0.0000121737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0710  hypothetical protein  27.76 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.410698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0686  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000157748  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  27.24 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3285  hypothetical protein  26.91 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0505048  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  27.48 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3931  hypothetical protein  24.29 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3587  hypothetical protein  26 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.204251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  28.74 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  27.46 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  27.46 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  26.02 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3529  protein of unknown function DUF481  25.87 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  24.43 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04136  hypothetical protein  24.4 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.580295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  29.94 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  24.42 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  22.83 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1224  hypothetical protein  24.11 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  30.4 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1257  putative salt-induced outer membrane protein  23.72 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  26.32 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  24.89 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  23.87 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  24.45 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  24.45 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  24.45 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2781  hypothetical protein  25.88 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  23.37 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002336  membrane protein  25.9 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  26.54 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0381  hypothetical protein  24.44 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.542158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1110  hypothetical protein  24.08 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1484  hypothetical protein  27.23 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00019  hypothetical protein  25.48 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3404  hypothetical protein  22.61 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3487  hypothetical protein  22.17 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3551  protein of unknown function DUF481  22.17 
 
 		 262 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  24.78 
 
 		 333 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>