27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8818 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  100 
 
 
371 aa  762    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  29.89 
 
 
310 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  29.66 
 
 
318 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  28.86 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  28.46 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  28.13 
 
 
305 aa  97.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  28.21 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  25.07 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  30.2 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  28.49 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  28.37 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  28.37 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  23.68 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  24.07 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  24.11 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  23.04 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  25.13 
 
 
360 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  25.21 
 
 
342 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  23.49 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  28.8 
 
 
349 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  22.88 
 
 
388 aa  46.2  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  26.75 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  33.33 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
273 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>