138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8559 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 
465 aa  918    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  77.59 
 
 
471 aa  688    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  76.2 
 
 
463 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  84.02 
 
 
469 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  72.89 
 
 
503 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  69.33 
 
 
475 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  70.88 
 
 
507 aa  591  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  67.68 
 
 
477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  68.7 
 
 
476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  65.62 
 
 
511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  65.94 
 
 
473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  65.72 
 
 
461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  59.74 
 
 
462 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  62.06 
 
 
480 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  61.99 
 
 
475 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  61.74 
 
 
463 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  62.17 
 
 
463 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  61.49 
 
 
461 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  61.49 
 
 
461 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  61.49 
 
 
461 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  58.79 
 
 
478 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  58.87 
 
 
469 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  62.88 
 
 
464 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  61.49 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  49.57 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.76 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.45 
 
 
502 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.01 
 
 
499 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.45 
 
 
460 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.12 
 
 
475 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.85 
 
 
487 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45 
 
 
486 aa  359  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  48.02 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  51.21 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.78 
 
 
473 aa  356  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  41.14 
 
 
510 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.4 
 
 
512 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  44.57 
 
 
473 aa  348  9e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  40.98 
 
 
497 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  27.95 
 
 
334 aa  67  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.82 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.51 
 
 
374 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  27.44 
 
 
306 aa  63.9  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.7 
 
 
357 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.95 
 
 
689 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  27.78 
 
 
637 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.8 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  27.78 
 
 
637 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.59 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.42 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.5 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.3 
 
 
337 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.3 
 
 
337 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.83 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.53 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  26.73 
 
 
334 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  26.73 
 
 
334 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.71 
 
 
348 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.03 
 
 
341 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.46 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  27.52 
 
 
334 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.73 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  27.76 
 
 
719 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  25.61 
 
 
307 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  25.81 
 
 
334 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.98 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.12 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.42 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  24.9 
 
 
304 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.57 
 
 
358 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.57 
 
 
358 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  25.35 
 
 
304 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.36 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.36 
 
 
362 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  28 
 
 
362 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  28.84 
 
 
669 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.14 
 
 
362 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1750  ATPase  26.98 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  25.18 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  29.06 
 
 
660 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.89 
 
 
362 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.37 
 
 
337 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  29.02 
 
 
670 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.25 
 
 
362 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.75 
 
 
394 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.25 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  31.2 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  25.24 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2027  AAA ATPase  28.08 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  25.93 
 
 
339 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.94 
 
 
363 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  27.32 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  23.74 
 
 
377 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.94 
 
 
306 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.89 
 
 
678 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  23.53 
 
 
370 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  28.42 
 
 
364 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  26.89 
 
 
680 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.1 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.84 
 
 
673 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>