41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8414 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8414  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  100 
 
 		 341 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1185  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  39.68 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.423386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0506  hypothetical protein  33.94 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00681957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3889  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.05 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1341  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.15 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2175  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.54 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3641  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.12 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0836  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.49 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3272  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.79 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.215097  normal  0.161649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2899  sigma factor algU regulatory protein MucB  29.41 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1794  sigma factor algU regulatory protein MucB  30.07 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.466338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2625  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.79 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03002  putative anti sigma E (sigma 24) factor, negative regulator  27.62 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000479672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2846  sigma factor negative regulatory protein MucB/ResB family  30.07 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2784  sigma factor negative regulatory protein MucB/ResB family  29.73 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2810  sigma factor algU regulatory protein MucB  30.07 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0644  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.78 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2471  sigma factor algU regulatory protein MucB  30.07 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0538  sigma factor algU regulatory protein MucB  29.41 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1725  sigma factor algU regulatory protein MucB  29.41 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2904  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.7 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691931  normal  0.381223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3066  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.25 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2093  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.03 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1738  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.56 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4241  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.73 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1080  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.84 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1087  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.37 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002493  sigma factor RpoE negative regulatory protein RseB precursor  27.82 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000011568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1129  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.37 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0038  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  30.32 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.622863  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0649  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.37 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1184  periplasmic negative regulator of sigmaE  31.58 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0279253  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3606  periplasmic negative regulator of sigmaE  31.58 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00546678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03540  periplasmic negative regulator of sigmaE  27.27 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1397  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.85 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1131  periplasmic negative regulator of sigmaE  31.58 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0410251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3674  periplasmic negative regulator of sigmaE  28.57 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.627713  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2319  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.3 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1469  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  30.19 
 
 		 315 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1748  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.83 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1100  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21.85 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>