22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7027 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7027  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  45.92 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 490 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  38.96 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  36.21 
 
 		 489 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 117 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9533  transcriptional regulator Cro/CI family  33.9 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140693  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.98 
 
 		 199 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>