59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4703 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  99.43 
 
 		 1092 bp  1685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4703    100 
 
 		 870 bp  1725    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  99.43 
 
 		 1092 bp  1685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  99.43 
 
 		 1092 bp  1685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  82.96 
 
 		 1098 bp  337  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4739    91.19 
 
 		 595 bp  248  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150445  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4774    89.81 
 
 		 483 bp  127  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  81.47 
 
 		 1101 bp  119  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  78.69 
 
 		 1092 bp  89.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  78.69 
 
 		 1881 bp  89.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  78.79 
 
 		 1170 bp  79.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  78.79 
 
 		 1089 bp  79.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  78.79 
 
 		 1089 bp  79.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  78.79 
 
 		 1089 bp  79.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  82.35 
 
 		 1068 bp  69.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  81.67 
 
 		 1086 bp  63.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  81.67 
 
 		 1086 bp  63.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4091    86.11 
 
 		 273 bp  63.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  81.51 
 
 		 1095 bp  61.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  78.71 
 
 		 1089 bp  60  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  78.71 
 
 		 1089 bp  60  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  78.71 
 
 		 1089 bp  60  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  78.71 
 
 		 1089 bp  60  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  78.71 
 
 		 1089 bp  60  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  78.71 
 
 		 1089 bp  60  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  87.72 
 
 		 1089 bp  58  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  87.72 
 
 		 1089 bp  58  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  79.87 
 
 		 1092 bp  58  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9090    81.73 
 
 		 1093 bp  56  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  85.94 
 
 		 1092 bp  56  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    89.36 
 
 		 1113 bp  54  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  84.85 
 
 		 1041 bp  52  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    86.54 
 
 		 2871 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  86.54 
 
 		 1092 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  93.75 
 
 		 3531 bp  48.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0620    87.5 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  85.71 
 
 		 1098 bp  48.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  86.54 
 
 		 1080 bp  48.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>