25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4739 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4739    100 
 
 		 595 bp  1179    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150445  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  87.8 
 
 		 1092 bp  480  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  87.75 
 
 		 1092 bp  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  87.75 
 
 		 1092 bp  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4686    91.16 
 
 		 255 bp  276  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.24302  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4774    91.41 
 
 		 483 bp  272  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4703    91.19 
 
 		 870 bp  248  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  83.2 
 
 		 1098 bp  81.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2612    100 
 
 		 2871 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0337479  normal  0.101338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2146    100 
 
 		 186 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000363504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1080 bp  54  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>