10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4774 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4774    100 
 
 		 483 bp  957    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4739    91.41 
 
 		 595 bp  272  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150445  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  90.05 
 
 		 1092 bp  228  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  90.05 
 
 		 1092 bp  228  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  90.05 
 
 		 1092 bp  228  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4703    89.81 
 
 		 870 bp  127  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4686    90.7 
 
 		 255 bp  107  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.24302  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  80.87 
 
 		 1098 bp  85.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  79.41 
 
 		 1092 bp  48.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  79.41 
 
 		 1881 bp  48.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>