26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2112 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  57.81 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  38.93 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  41.61 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  43.55 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  38.33 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  34.4 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  36.43 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3597  hypothetical protein  40.91 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  36.59 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  34.09 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  36.57 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  34.4 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  32.86 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  32.86 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  32.86 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1439  hypothetical protein  40.62 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  30.94 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  30.6 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  33.96 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  37.11 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  39.18 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>