31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0168 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1422    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  31.76 
 
 
724 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  31.76 
 
 
724 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  31.76 
 
 
724 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  31.41 
 
 
709 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  32.46 
 
 
741 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  31.93 
 
 
713 aa  229  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  29.1 
 
 
714 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  31.83 
 
 
714 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  31.22 
 
 
721 aa  211  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  28.8 
 
 
717 aa  210  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  29.12 
 
 
707 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  30.68 
 
 
572 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6008  hypothetical protein  54 
 
 
100 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5426  hypothetical protein  54 
 
 
100 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.705268 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  29.1 
 
 
645 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  51.43 
 
 
104 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  51.43 
 
 
104 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.642999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  24.92 
 
 
731 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  24.92 
 
 
731 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  22.62 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  22.62 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  22.62 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  22.62 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  22.62 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  22.62 
 
 
624 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  27.31 
 
 
616 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  29.56 
 
 
688 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  24.85 
 
 
475 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  24.35 
 
 
568 aa  47.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3511  hypothetical protein  23.96 
 
 
729 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>