62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0374 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0374  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.65 
 
 
208 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.78 
 
 
208 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  94.78 
 
 
208 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  93.91 
 
 
208 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  66.67 
 
 
205 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  59.26 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.46 
 
 
206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  54.63 
 
 
205 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.43 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  45.61 
 
 
209 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  46.43 
 
 
209 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  44.35 
 
 
206 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  45.13 
 
 
211 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.52 
 
 
208 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  37.74 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  35.85 
 
 
208 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  33.64 
 
 
208 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  32.71 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  30.19 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  29.25 
 
 
208 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  26.98 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  27.27 
 
 
223 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1354  hypothetical protein  35.94 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  34.71 
 
 
224 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  33.02 
 
 
222 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  30.83 
 
 
222 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.79 
 
 
218 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  27.59 
 
 
215 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
221 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  32.99 
 
 
222 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  25.22 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  31.91 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.56 
 
 
233 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  26.56 
 
 
233 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.91 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.56 
 
 
233 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  26.67 
 
 
201 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  27.19 
 
 
214 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
221 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  32.18 
 
 
218 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  29.17 
 
 
222 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.25 
 
 
221 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
220 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.66 
 
 
221 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.61 
 
 
222 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.23 
 
 
222 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  27.5 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.23 
 
 
222 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  25.23 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.02 
 
 
222 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  27.05 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  29.29 
 
 
225 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  26.02 
 
 
225 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  27.27 
 
 
224 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  26.27 
 
 
214 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  26.61 
 
 
232 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  22.4 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  30.28 
 
 
218 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  30 
 
 
221 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>