29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0255 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  98.99 
 
 		 398 aa  791    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  100 
 
 		 406 aa  813    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  58.75 
 
 		 407 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  26.37 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  25.17 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  26.6 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  34.09 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  24.93 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  26.49 
 
 		 451 aa  94.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  31.64 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  30.46 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  24.29 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  22.57 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  25 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  23.29 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  23.1 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  24.06 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  24.06 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  21.63 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  23.38 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  22.46 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  24.35 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  23.99 
 
 		 493 aa  53.9  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  23.12 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  22.44 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  21.31 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  22.97 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  23.05 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  23.94 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>