27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4451 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  296  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  41.51 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  40.57 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  40.57 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  42.57 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  37.33 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.56 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  37.25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  30.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  36.17 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  31.46 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  26.96 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  26.85 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  28.3 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  32.65 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5762  hypothetical protein  30.3 
 
 		 279 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2436  hypothetical protein  29.29 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16266  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2431  hypothetical protein  29.29 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1820  hypothetical protein  29.29 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>