34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4171 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1019    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4088  hypothetical protein  96.99 
 
 		 498 aa  916    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0335  hypothetical protein  97.19 
 
 		 498 aa  919    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0658  hypothetical protein  53.36 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3707  hypothetical protein  51.08 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0681  hypothetical protein  42.89 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3328  hypothetical protein  40.36 
 
 		 502 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4513  hypothetical protein  41.9 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0437  putative secreted protein  41.21 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2946  hypothetical protein  40.56 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1186  hypothetical protein  41.53 
 
 		 472 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0950  hypothetical protein  43.94 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0504  hypothetical protein  41.7 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2351  hypothetical protein  41.44 
 
 		 472 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000118679  unclonable  0.000000241983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1258  putative secreted protein  40.82 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1400  putative secreted protein  40.82 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3422  putative secreted protein  40.75 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3021  hypothetical protein  39.92 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333759  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59920  hypothetical protein  43.66 
 
 		 501 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000417917  hitchhiker  0.0000000000150468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1166  hypothetical protein  40.41 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2188  hypothetical protein  43.35 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2392  hypothetical protein  43.15 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2857  hypothetical protein  41.08 
 
 		 472 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.560129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1762  hypothetical protein  42.54 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1444  hypothetical protein  41.45 
 
 		 494 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1628  putative secreted protein  41.32 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0861  hypothetical protein  43.23 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36260  hypothetical protein  39.52 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4177  putative secreted protein  40.54 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.113343  normal  0.692666 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0646  hypothetical protein  37.15 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3928  hypothetical protein  35.51 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.472883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2390  hypothetical protein  27.13 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1062  hypothetical protein  25.52 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1024  hypothetical protein  25.98 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>