34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1869 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  100 
 
 
376 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  58.4 
 
 
385 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  58.4 
 
 
385 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  58.13 
 
 
385 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  58.13 
 
 
385 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  58.4 
 
 
385 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  58.13 
 
 
385 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  58.13 
 
 
385 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  58.13 
 
 
385 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  58.13 
 
 
385 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  57.18 
 
 
385 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  57.07 
 
 
384 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  57.07 
 
 
384 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  56.8 
 
 
384 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  57.07 
 
 
384 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  56.8 
 
 
384 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1660  osmoregulated periplasmic glucan biosynthetic protein  53.08 
 
 
127 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  34.02 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  26.41 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  24.81 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  32.97 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  32.98 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  20.58 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  21.62 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  33.33 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6950  glucans biosynthesis protein  28.04 
 
 
478 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.91383  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0523  acyltransferase family protein  25.14 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  20.53 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2757  acyltransferase 3  22.99 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298501  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  26.57 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  29.7 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  33.77 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  31.88 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  23.48 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>