26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0348 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  89.55 
 
 		 134 aa  221  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  86.57 
 
 		 134 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  38.94 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  38.98 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  37.8 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  37.7 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  35.4 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  36.52 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  34.15 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  36.51 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  36.51 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  36.44 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  34.21 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  42.34 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  36.04 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  32.03 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  37.74 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  31.86 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  36.27 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3925  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  33.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>