30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0818 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
379 aa  789    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.48 
 
 
355 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.68 
 
 
398 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  47.12 
 
 
381 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.62 
 
 
402 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48.45 
 
 
410 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.23 
 
 
403 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.23 
 
 
358 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.2 
 
 
408 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.91 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.09 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  47.55 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.82 
 
 
377 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.58 
 
 
377 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.62 
 
 
377 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.32 
 
 
379 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.56 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  41.18 
 
 
394 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  39.3 
 
 
338 aa  262  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  36.46 
 
 
317 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.55 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.59 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.3 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.79 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.05 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.35 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.13 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>