22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5768 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5768  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  202  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.420721  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  40 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  45.33 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  46.58 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  38.27 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  34.04 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  30.91 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  36.36 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  39.73 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  34.88 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  37.66 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  34.55 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  36.17 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  36.49 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03620  Protein of unknown function (DUF2516)  30.84 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.693043  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  34.09 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>