25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3655 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  163  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  64.1 
 
 
82 aa  94.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  45.16 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  39.36 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  45.45 
 
 
80 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  37.23 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  39.51 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  37.35 
 
 
89 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  37.35 
 
 
89 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  38.57 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  38.57 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  38.57 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  38.37 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  37.04 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  35.71 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  35.71 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4947  hypothetical protein  70 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.449635  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  39.66 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  37.31 
 
 
81 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0101  hypothetical protein  62.96 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  35.56 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  37.88 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>