15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3103 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  30.63 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  31.72 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  37.11 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  32 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  32.94 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  33.73 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  33.73 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  32.32 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  28.71 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  33.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  27.78 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.24 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  35.29 
 
 		 167 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>