40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4457 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  247  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.83 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.86 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  47.97 
 
 		 130 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  51.75 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  50.42 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.98 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.78 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  42.5 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.72 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  38.4 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  40.5 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  36.8 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  37.3 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 		 131 aa  87  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  35.94 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  36.8 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  36.8 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  36.51 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  39.2 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  38.94 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  38.94 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2973  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3078  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.515742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2073  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01792  glyoxylase I family protein  45.83 
 
 		 55 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  35 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>