58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3797 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3797  YidE/YbjL domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3913  YidE/YbjL domain-containing protein  74.77 
 
 		 589 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0230126  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0096  YidE/YbjL duplication  77.48 
 
 		 561 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0519277  normal  0.835648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3482  YidE/YbjL duplication  75.68 
 
 		 563 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2708  YidE/YbjL duplication  64.86 
 
 		 561 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3892  aspartate/alanine exchanger family protein  61.26 
 
 		 560 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0789  YidE/YbjL duplication  61.26 
 
 		 560 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3045  YidE/YbjL duplication  47.22 
 
 		 560 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2707  YidE/YbjL duplication  50 
 
 		 564 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3839  YidE/YbjL duplication  42.74 
 
 		 562 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0788  YidE/YbjL duplication  51.69 
 
 		 560 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.442707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3893  aspartate/alanine exchanger family protein  50.56 
 
 		 560 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1985  YidE/YbjL duplication  44.44 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0595755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3938  YidE/YbjL duplication  37.27 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2143  hypothetical protein  35.78 
 
 		 562 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4847  putative transporter  41.67 
 
 		 567 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0674099  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1586  YidE/YbjL duplication  33.98 
 
 		 563 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0715  hypothetical protein  35.21 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3841  YidE/YbjL duplication  34.58 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02636  hypothetical protein  31.72 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1851  YidE/YbjL duplication  35.48 
 
 		 561 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0417927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03065  hypothetical protein  30.51 
 
 		 575 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1001  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588292  normal  0.272604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00858  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2485  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0874  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2749  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2795  YidE/YbjL duplication  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00852  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0919  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0950  hypothetical protein  33.96 
 
 		 561 aa  52  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1362  hypothetical protein  33.02 
 
 		 561 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1639  hypothetical protein  30.05 
 
 		 562 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2029  hypothetical protein  31.29 
 
 		 560 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0129834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0975  hypothetical protein  34 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0907  hypothetical protein  34 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1023  hypothetical protein  34 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1004  hypothetical protein  34 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0943  hypothetical protein  34 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2734  hypothetical protein  34 
 
 		 562 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2649  hypothetical protein  34 
 
 		 562 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1952  hypothetical protein  33 
 
 		 562 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00456321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1559  hypothetical protein  34 
 
 		 562 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01390  predicted permease  36.67 
 
 		 522 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0870  YidE/YbjL duplication  34.58 
 
 		 534 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2952  YidE/YbjL duplication  28.81 
 
 		 579 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1686  hypothetical protein  33 
 
 		 562 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0560693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1198  probable membrane permease  28.78 
 
 		 625 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2293  hypothetical protein  33 
 
 		 562 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0281  YidE/YbjL duplication  29.82 
 
 		 549 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00426862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4738  YidE/YbjL duplication  29.06 
 
 		 581 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0018  YidE/YbjL duplication  31.82 
 
 		 529 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0175151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0856  YidE/YbjL duplication  29.05 
 
 		 537 aa  46.2  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.682157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1016  Trk family potassium uptake protein  33.94 
 
 		 546 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2393  hypothetical protein  28.95 
 
 		 562 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2470  YidE/YbjL duplication  29.91 
 
 		 522 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00004763  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3636  YidE/YbjL duplication  25.28 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1476  YidE/YbjL duplication  33.33 
 
 		 530 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>