14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1646 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1229    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  42.05 
 
 		 701 aa  343  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  41.77 
 
 		 669 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  59.79 
 
 		 794 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  50.41 
 
 		 781 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  39.25 
 
 		 811 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  28.17 
 
 		 756 aa  67.4  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  29.35 
 
 		 671 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  26.09 
 
 		 762 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  35.07 
 
 		 632 aa  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  37.66 
 
 		 957 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3433  hypothetical protein  41.79 
 
 		 613 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.709149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  25.48 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  25.21 
 
 		 814 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>