42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0289 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 329 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.68 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 317 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  25 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  27.67 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.1 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.09 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.09 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  27.57 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  26.04 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.07 
 
 		 2401 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 1435 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 841 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  22.73 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>