More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2731 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  75.32 
 
 		 467 aa  692    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 458 aa  931    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  74.89 
 
 		 467 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  75.95 
 
 		 474 aa  708    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 459 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 472 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 457 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 487 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 486 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 460 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>