21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1323 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  212  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  54.02 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  37.21 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  42.57 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  43.14 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  34.02 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  35.79 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  31.68 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3598  hypothetical protein  44.19 
 
 		 275 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.356633  normal  0.227709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  32.65 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  36.14 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  36.67 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>