16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0309 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0309  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443313  normal  0.0752906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  61.39 
 
 
158 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  32.93 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  30.18 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.76 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  30.07 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  31.01 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  27.97 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  30.87 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  31.08 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  28.47 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  29.66 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  29.14 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  27.27 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>