30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7052 on replicon NC_013737
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
98 aa  205  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7016  protein of unknown function DUF497  47.31 
 
 
106 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000453911  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  31.96 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  32.29 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  33.7 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  33.7 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  30 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  30.53 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  44.68 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  27.47 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  31.25 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  31.25 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  33.68 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  30.85 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  26.04 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  28.26 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  32.98 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  35.11 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  35.11 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  26.6 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  29.29 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  25 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  30 
 
 
91 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>