220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5543 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5543  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
456 aa  951    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4017  oxidoreductase, Fe-S subunit  62.83 
 
 
447 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610189  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0122  oxidoreductase, Fe-S subunit  56.02 
 
 
440 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5886  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  56.14 
 
 
440 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0747  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.09 
 
 
425 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556917  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11073  iron-sulfur protein  50.33 
 
 
443 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4583  Fe-S oxidoreductase-like protein  48.24 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2114  Fe-S oxidoreductase N-terminal region  48.44 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.24979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.87 
 
 
664 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  31.88 
 
 
659 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.62 
 
 
683 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  29.52 
 
 
658 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  29.74 
 
 
661 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.98 
 
 
664 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  29.5 
 
 
652 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.31 
 
 
658 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  27.51 
 
 
678 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.07 
 
 
663 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  28.07 
 
 
703 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.23 
 
 
656 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.31 
 
 
658 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.65 
 
 
699 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.88 
 
 
656 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  27.03 
 
 
703 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  27.03 
 
 
703 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  27.03 
 
 
703 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  27.03 
 
 
703 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  26.93 
 
 
703 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  27.03 
 
 
703 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  26.72 
 
 
703 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  26.82 
 
 
703 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  26.82 
 
 
703 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.19 
 
 
698 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
663 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.39 
 
 
655 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  27.29 
 
 
655 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  27.29 
 
 
1044 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  27.88 
 
 
882 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  26.68 
 
 
1027 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.84 
 
 
699 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.89 
 
 
711 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.07 
 
 
679 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.66 
 
 
676 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.98 
 
 
1046 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  27.98 
 
 
1046 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  25.94 
 
 
711 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  27.98 
 
 
1042 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  26.15 
 
 
688 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.1 
 
 
711 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  28.41 
 
 
716 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  27.48 
 
 
699 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  26.78 
 
 
661 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.01 
 
 
694 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  29.16 
 
 
739 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  27.27 
 
 
678 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.76 
 
 
686 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  26.39 
 
 
629 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.83 
 
 
722 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.4 
 
 
743 aa  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  25.73 
 
 
692 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  25.85 
 
 
683 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.87 
 
 
712 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  28.72 
 
 
1033 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  26.32 
 
 
716 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  25.17 
 
 
661 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.28 
 
 
737 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25 
 
 
713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.2 
 
 
762 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  29.54 
 
 
683 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  25.81 
 
 
703 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  27.13 
 
 
727 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.87 
 
 
989 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24 
 
 
641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.17 
 
 
717 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  24.95 
 
 
671 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.76 
 
 
694 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.79 
 
 
748 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.46 
 
 
721 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  22.54 
 
 
714 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  24.79 
 
 
732 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  25.36 
 
 
1388 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  24.78 
 
 
661 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  23.25 
 
 
730 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.97 
 
 
737 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.74 
 
 
1215 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  23.99 
 
 
727 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  23.83 
 
 
718 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.39 
 
 
758 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  21.89 
 
 
752 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  25.74 
 
 
762 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  24.56 
 
 
661 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.54 
 
 
774 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  26.89 
 
 
662 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.78 
 
 
714 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.28 
 
 
722 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.5 
 
 
662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.71 
 
 
1131 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.32 
 
 
728 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.61 
 
 
661 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.75 
 
 
695 aa  110  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>