194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0122 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0122  oxidoreductase, Fe-S subunit  100 
 
 		 440 aa  916    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4017  oxidoreductase, Fe-S subunit  58.65 
 
 		 447 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5886  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.5 
 
 		 440 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0747  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.31 
 
 		 425 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5543  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.37 
 
 		 456 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11073  iron-sulfur protein  53.72 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2114  Fe-S oxidoreductase N-terminal region  55.3 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.24979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4583  Fe-S oxidoreductase-like protein  53.05 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  31.88 
 
 		 658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  29.89 
 
 		 652 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.72 
 
 		 664 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.14 
 
 		 663 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.84 
 
 		 658 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.77 
 
 		 658 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.75 
 
 		 663 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.95 
 
 		 664 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.62 
 
 		 679 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  31.07 
 
 		 655 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  30.3 
 
 		 683 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  30.23 
 
 		 688 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  28.9 
 
 		 659 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.39 
 
 		 683 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.48 
 
 		 699 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.22 
 
 		 717 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  28.51 
 
 		 678 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.05 
 
 		 655 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  32.71 
 
 		 699 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  28.21 
 
 		 882 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.04 
 
 		 699 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  31.48 
 
 		 716 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.51 
 
 		 676 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.26 
 
 		 698 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.32 
 
 		 711 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 		 656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  29.21 
 
 		 661 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  29.66 
 
 		 661 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.1 
 
 		 711 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.19 
 
 		 743 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  29.36 
 
 		 739 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  28.15 
 
 		 661 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.16 
 
 		 656 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.29 
 
 		 694 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.96 
 
 		 737 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  28.23 
 
 		 711 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.02 
 
 		 989 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.66 
 
 		 1046 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1046 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1033 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1042 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  26.37 
 
 		 727 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  27.51 
 
 		 703 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.65 
 
 		 713 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.16 
 
 		 712 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  27.15 
 
 		 703 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1044 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  27.07 
 
 		 703 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  26.49 
 
 		 714 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  28.81 
 
 		 678 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  28.21 
 
 		 727 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.59 
 
 		 1215 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  27.61 
 
 		 716 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1027 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  30.53 
 
 		 683 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  28.95 
 
 		 732 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.58 
 
 		 686 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.27 
 
 		 694 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.19 
 
 		 737 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  28.79 
 
 		 718 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  28.8 
 
 		 663 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.06 
 
 		 758 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.99 
 
 		 661 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.65 
 
 		 722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.66 
 
 		 762 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  24.89 
 
 		 730 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.29 
 
 		 748 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.48 
 
 		 721 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  26.67 
 
 		 692 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  28.14 
 
 		 762 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.64 
 
 		 662 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.08 
 
 		 661 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  27.16 
 
 		 629 aa  136  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  26.72 
 
 		 661 aa  136  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.96 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  27.2 
 
 		 703 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  26.78 
 
 		 671 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  26.92 
 
 		 1388 aa  134  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.88 
 
 		 641 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.59 
 
 		 774 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.91 
 
 		 738 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  24.34 
 
 		 752 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.94 
 
 		 695 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.58 
 
 		 1131 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.16 
 
 		 737 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>