28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4714 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
1055 aa  2180    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.23 
 
 
1038 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.07 
 
 
1036 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.17 
 
 
1013 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.74 
 
 
1042 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.24 
 
 
1148 aa  477  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  31.33 
 
 
1060 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.56 
 
 
757 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  34.09 
 
 
317 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.54 
 
 
968 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.46 
 
 
964 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  26.02 
 
 
1074 aa  94  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.7 
 
 
987 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  26.52 
 
 
1029 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.43 
 
 
1021 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.55 
 
 
1066 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.09 
 
 
1035 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.34 
 
 
1042 aa  69.3  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  22.4 
 
 
1027 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  27.08 
 
 
1031 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.73 
 
 
729 aa  62.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.34 
 
 
916 aa  58.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  25.66 
 
 
373 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1491  hypothetical protein  42.86 
 
 
357 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.13 
 
 
919 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.94 
 
 
915 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.15 
 
 
1009 aa  46.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4231  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.02 
 
 
962 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>