15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1491 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1491  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5327  hypothetical protein  27.21 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0551  hypothetical protein  29.87 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3693  hypothetical protein  28.82 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2587  hypothetical protein  27.62 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12565  normal  0.0985735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4230  hypothetical protein  24.13 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2432  hypothetical protein  27.68 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252677  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4204  putative lantibiotic biosynthesis protein  24.11 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4200  hypothetical protein  29.41 
 
 
336 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  26.37 
 
 
518 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  42.86 
 
 
1055 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.39 
 
 
1042 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.2 
 
 
1148 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0924  hypothetical protein  25.81 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.812313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.89 
 
 
1060 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>