14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4204 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4204  putative lantibiotic biosynthesis protein  100 
 
 
373 aa  757    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3693  hypothetical protein  52.52 
 
 
347 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2587  hypothetical protein  45.74 
 
 
355 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12565  normal  0.0985735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2432  hypothetical protein  46.59 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252677  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4230  hypothetical protein  23.19 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0551  hypothetical protein  27.3 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0924  hypothetical protein  21.88 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.812313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1491  hypothetical protein  24.93 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4200  hypothetical protein  25.36 
 
 
336 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5327  hypothetical protein  25.64 
 
 
278 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  23.74 
 
 
518 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.29 
 
 
1148 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0552  hypothetical protein  23.39 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  31.18 
 
 
1036 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>