10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3693 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3693  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2432  hypothetical protein  55.95 
 
 
355 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252677  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2587  hypothetical protein  53.56 
 
 
355 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12565  normal  0.0985735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4204  putative lantibiotic biosynthesis protein  52.52 
 
 
373 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4230  hypothetical protein  24.3 
 
 
327 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0551  hypothetical protein  29.46 
 
 
298 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1491  hypothetical protein  28.82 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0924  hypothetical protein  27.04 
 
 
340 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.812313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5327  hypothetical protein  23.99 
 
 
278 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.95 
 
 
1148 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>