12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4564 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  350  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  50.29 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  49.1 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2906  hypothetical protein  41.07 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  36.88 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  35.66 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  34.75 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  31.91 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  30.2 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  30.85 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>