18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4512 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  46.55 
 
 
117 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  42.74 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  35.9 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  39.39 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0820  hypothetical protein  38.95 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0617234  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  33.9 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  30.69 
 
 
113 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  29.82 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  22.77 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  32.2 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  31.03 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  26.13 
 
 
110 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  27.45 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  28.43 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4629  hypothetical protein  32.61 
 
 
94 aa  40  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>