12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3902 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3902  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  343  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0447997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3910  hypothetical protein  76.19 
 
 		 170 aa  261  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.257204  normal  0.0784799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3898  hypothetical protein  35.54 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128161 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5954  hypothetical protein  32.33 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4723  hypothetical protein  31.36 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3640  hypothetical protein  31.36 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3881  nuclear transport factor 2  30.51 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7237  hypothetical protein  28.68 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal  0.0625132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  28.68 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3900  hypothetical protein  31.17 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  27.35 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>