More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3665 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
388 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.67 
 
 
396 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.7 
 
 
389 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.35 
 
 
389 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.41 
 
 
390 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  60.26 
 
 
389 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.35 
 
 
388 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.33 
 
 
389 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.07 
 
 
392 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.58 
 
 
389 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.58 
 
 
392 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.33 
 
 
389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  54.87 
 
 
388 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.87 
 
 
388 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  54.87 
 
 
388 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.59 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.41 
 
 
389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.28 
 
 
401 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.28 
 
 
401 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.42 
 
 
405 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.08 
 
 
389 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.7 
 
 
393 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.85 
 
 
389 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.2 
 
 
390 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.56 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.15 
 
 
397 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
395 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.9 
 
 
392 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.79 
 
 
391 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.17 
 
 
391 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  50.51 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  50.77 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  50.9 
 
 
394 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 
391 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  50.64 
 
 
394 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
394 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.23 
 
 
391 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
399 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 
390 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.36 
 
 
390 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.85 
 
 
390 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.85 
 
 
390 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.62 
 
 
390 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  49.36 
 
 
390 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.1 
 
 
390 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
389 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  49.23 
 
 
391 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  48.34 
 
 
390 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.48 
 
 
392 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3017  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.8 
 
 
520 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3146  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.8 
 
 
520 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1366  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
452 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 
390 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.64 
 
 
390 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.99 
 
 
390 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.59 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3638  alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
390 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
391 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.99 
 
 
387 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.26 
 
 
384 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45 
 
 
384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45 
 
 
384 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3395  alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 
394 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270648  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.79 
 
 
385 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.84 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5460  alcohol dehydrogenase  45.91 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  43.65 
 
 
415 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  42.6 
 
 
412 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.6 
 
 
412 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  42.6 
 
 
412 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  42.6 
 
 
412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
384 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.09 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.6 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  42.13 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.84 
 
 
412 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.58 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.58 
 
 
412 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 
412 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  41.58 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.58 
 
 
412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.07 
 
 
411 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
400 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
388 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
388 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
385 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.31 
 
 
400 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
385 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
400 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.23 
 
 
376 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
411 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.74 
 
 
382 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.75 
 
 
410 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 
382 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
396 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.64 
 
 
390 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>