40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2158 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2158  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7062  lipolytic protein G-D-S-L family  74.65 
 
 
248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3296  lipolytic protein G-D-S-L family  70.89 
 
 
227 aa  316  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0413937  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  34.76 
 
 
728 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1351  hypothetical protein  33.63 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.946704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  33.85 
 
 
524 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  24.89 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  26.78 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  25.13 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  22.77 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  22.01 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  20.81 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  25.6 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10529  hypothetical protein  27.91 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.6 
 
 
223 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  24.77 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  24.02 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  20.98 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  29.01 
 
 
268 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  22.33 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.21 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.21 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.21 
 
 
216 aa  45.1  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  25.28 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.56 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  22.28 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  25.81 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  21.43 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  24.87 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.13 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  21.36 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  22.22 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  22.22 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  22.22 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  24.34 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  25.13 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  25.13 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  23.47 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  22.55 
 
 
195 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>