More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0807 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.87 
 
 
774 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.620498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0807  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
797 aa  1644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0192  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.26 
 
 
773 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047177  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00965  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.16 
 
 
652 aa  325  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1288  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.16 
 
 
684 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.7 
 
 
426 aa  118  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  27.63 
 
 
432 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32 
 
 
435 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.72 
 
 
447 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  29.32 
 
 
439 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  29.32 
 
 
439 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.72 
 
 
431 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.34 
 
 
431 aa  108  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  30.8 
 
 
441 aa  108  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.45 
 
 
430 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  34.09 
 
 
475 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  29.48 
 
 
441 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  33.33 
 
 
469 aa  105  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.7 
 
 
430 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.34 
 
 
428 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  31.78 
 
 
452 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.44 
 
 
440 aa  103  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.91 
 
 
430 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  30.34 
 
 
428 aa  103  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.78 
 
 
452 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  29.77 
 
 
443 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.36 
 
 
428 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  31.01 
 
 
451 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.57 
 
 
426 aa  102  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.96 
 
 
428 aa  101  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  32.72 
 
 
471 aa  101  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.72 
 
 
471 aa  101  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.38 
 
 
436 aa  99.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1771  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.8 
 
 
640 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.037293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.62 
 
 
452 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.82 
 
 
428 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.6 
 
 
434 aa  98.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.6 
 
 
434 aa  98.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.78 
 
 
433 aa  97.8  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.96 
 
 
437 aa  98.2  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.88 
 
 
427 aa  97.8  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.72 
 
 
442 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.42 
 
 
442 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.22 
 
 
434 aa  97.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  29.84 
 
 
452 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.84 
 
 
452 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.84 
 
 
452 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.6 
 
 
476 aa  96.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  32.86 
 
 
429 aa  95.1  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.26 
 
 
432 aa  94.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  32.86 
 
 
429 aa  94.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  32.57 
 
 
430 aa  94  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.69 
 
 
498 aa  93.6  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0756  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28 
 
 
696 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.42 
 
 
482 aa  93.2  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0878  peptidylprolyl isomerase  35.82 
 
 
285 aa  92.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.22 
 
 
428 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.22 
 
 
428 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.22 
 
 
428 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.22 
 
 
428 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.14 
 
 
459 aa  92.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.22 
 
 
428 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  33.77 
 
 
500 aa  91.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  29.46 
 
 
448 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.96 
 
 
473 aa  91.3  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  28.57 
 
 
430 aa  91.3  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  29.34 
 
 
463 aa  91.3  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  29.41 
 
 
453 aa  90.9  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  32.32 
 
 
500 aa  90.5  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  34.62 
 
 
427 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1929  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.48 
 
 
629 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.292959  normal  0.0390357 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  28.68 
 
 
450 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.82 
 
 
433 aa  89  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  28.68 
 
 
450 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.68 
 
 
448 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  31.13 
 
 
475 aa  88.2  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  28.68 
 
 
448 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  28.68 
 
 
448 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  28.68 
 
 
448 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  28.68 
 
 
448 aa  88.2  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.17 
 
 
434 aa  87.4  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.38 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2178  peptidylprolyl isomerase  36.72 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0828286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2144  peptidylprolyl isomerase  36.51 
 
 
283 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2115  peptidylprolyl isomerase  36.72 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000762926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  30.19 
 
 
434 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1050  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.59 
 
 
649 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2336  peptidylprolyl isomerase  36.72 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1755  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.11 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00496901  hitchhiker  0.000000595402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.69 
 
 
453 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2357  peptidylprolyl isomerase  36.72 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2436  peptidylprolyl isomerase  36.72 
 
 
283 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.79 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0336  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.32 
 
 
694 aa  85.5  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>