More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0192 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0192  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
773 aa  1600    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047177  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0807  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.26 
 
 
797 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.91 
 
 
774 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.620498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00965  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.61 
 
 
652 aa  386  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1288  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.85 
 
 
684 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.9 
 
 
454 aa  127  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2327  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.64 
 
 
442 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110216  normal  0.9972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.6 
 
 
437 aa  124  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  30.62 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.6 
 
 
436 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  34.07 
 
 
463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  32.74 
 
 
452 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.48 
 
 
453 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.74 
 
 
452 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  33.94 
 
 
453 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  31.39 
 
 
443 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  32.29 
 
 
450 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.29 
 
 
448 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  32.29 
 
 
450 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  32.29 
 
 
448 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  32.29 
 
 
448 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  32.29 
 
 
448 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  32.29 
 
 
448 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  32.74 
 
 
452 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.74 
 
 
452 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.74 
 
 
452 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.74 
 
 
452 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 
440 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  32.74 
 
 
448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  31.84 
 
 
451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.2 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  32.91 
 
 
427 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1077  peptidylprolyl isomerase  48.09 
 
 
286 aa  112  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.36 
 
 
438 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.33 
 
 
428 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00440274  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0643  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.76 
 
 
276 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  28.77 
 
 
432 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.29 
 
 
428 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.63 
 
 
442 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.94 
 
 
281 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0962  peptidylprolyl isomerase  45.26 
 
 
287 aa  108  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.44 
 
 
430 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.8 
 
 
428 aa  107  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0974  peptidylprolyl isomerase  45.26 
 
 
287 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1041  peptidylprolyl isomerase  45.26 
 
 
287 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1119  peptidylprolyl isomerase  45.26 
 
 
287 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.211203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  31.8 
 
 
428 aa  107  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4226  peptidylprolyl isomerase  45.67 
 
 
289 aa  107  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0107977  hitchhiker  0.00167093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  30.81 
 
 
430 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1207  peptidylprolyl isomerase  45.26 
 
 
287 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.54 
 
 
447 aa  107  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.15 
 
 
435 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  31.34 
 
 
428 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.88 
 
 
426 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.31 
 
 
427 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1145  peptidylprolyl isomerase  43.8 
 
 
287 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  28.31 
 
 
438 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0952  peptidylprolyl isomerase  43.8 
 
 
287 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3054  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.69 
 
 
325 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0251204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0014  SurA domain  29.11 
 
 
439 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86378  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  29.86 
 
 
429 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.51 
 
 
430 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0957  peptidylprolyl isomerase  42.75 
 
 
289 aa  103  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.51 
 
 
430 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  30.94 
 
 
429 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.84 
 
 
433 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.41 
 
 
428 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.41 
 
 
428 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.41 
 
 
428 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.41 
 
 
428 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.41 
 
 
428 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  31.86 
 
 
471 aa  100  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.86 
 
 
471 aa  99.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.02 
 
 
482 aa  99  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1477  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.7 
 
 
300 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.72081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1755  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.8 
 
 
300 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.77 
 
 
459 aa  97.4  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.56 
 
 
473 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.41 
 
 
498 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0878  peptidylprolyl isomerase  38.76 
 
 
285 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1477  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.45 
 
 
300 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218418  normal  0.108463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  28.07 
 
 
439 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  29.2 
 
 
434 aa  95.1  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  28.07 
 
 
441 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  28.07 
 
 
439 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  30.51 
 
 
433 aa  95.1  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0340  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.15 
 
 
700 aa  95.1  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  30.56 
 
 
464 aa  94.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1755  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.65 
 
 
460 aa  94.7  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00496901  hitchhiker  0.000000595402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  29.41 
 
 
430 aa  94.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.41 
 
 
431 aa  94.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1320  peptidylprolyl isomerase  41.18 
 
 
285 aa  94  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3255  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.6 
 
 
299 aa  94  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1243  peptidylprolyl isomerase  41.18 
 
 
285 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>