50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0288 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
214 aa  440  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  46.67 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  40 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  37.71 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  36.04 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  38.76 
 
 
192 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  39.77 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  35.65 
 
 
216 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  35.57 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  41.89 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  37.57 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  39.13 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  39.36 
 
 
317 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  38.51 
 
 
271 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  37.65 
 
 
300 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  33.66 
 
 
324 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  38.92 
 
 
272 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  33.84 
 
 
278 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  34.07 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  39.16 
 
 
261 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  33.98 
 
 
270 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  34.16 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  38.89 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  38.1 
 
 
265 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  33.12 
 
 
320 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  33.12 
 
 
320 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  36.11 
 
 
284 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  35.37 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  36.88 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  34.72 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  34.03 
 
 
285 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  36.3 
 
 
307 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  36.42 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  33.54 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  32.75 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  34.07 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  34.46 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  33.89 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  34.29 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  30.28 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  30.11 
 
 
296 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  29.55 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  33.11 
 
 
279 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  27.32 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  46.27 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  27.11 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  26.19 
 
 
274 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  33.57 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  32.99 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  28 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>