48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35420  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.279201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2435  multiple resistance and pH regulation protein F  67.37 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.38947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  66.67 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  53.64 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0212  multiple resistance and pH regulation protein F  67.44 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3718  multiple resistance and pH regulation protein F  46.25 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  50 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  50 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  45 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3869  hypothetical protein  43.9 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18930  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  48.15 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3656  hypothetical protein  41.25 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  54.24 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0042  multiple resistance and pH regulation protein F  54.44 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5210  hypothetical protein  42.22 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000708898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14790  Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)  43.33 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0594  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.75 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.22 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.912377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.75 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4626  multiple resistance and pH regulation protein F  50 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0166  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.89 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.569132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.25 
 
 		 95 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  35.16 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.26 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  40.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0093627  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4890  multiple resistance and pH regulation protein F  42.68 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  40.74 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  35.29 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  33.75 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2282  multiple resistance and pH regulation protein F  36 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.668808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1640  multiple resistance and pH regulation protein F  38.16 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2215  multiple resistance and pH regulation protein F  38.81 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.5 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.88 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  33.77 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0753  multiple resistance and pH regulation protein F  30.67 
 
 		 91 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0206212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  34.43 
 
 		 107 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2030  multiple resistance and pH regulation protein F  35.71 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16760  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  45.28 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0639498  normal  0.0887285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.92 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  30.86 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2972  multiple resistance and pH regulation protein F  28.75 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.94 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  25.61 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0498  multiple resistance and pH regulation protein F  41.25 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  25.61 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  32.39 
 
 		 87 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.58 
 
 		 88 aa  40.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>