56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4890 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4890  multiple resistance and pH regulation protein F  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0346  putative cation antiporter subunit  67.78 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.503467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  44.94 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0166  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  47.5 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.569132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3718  multiple resistance and pH regulation protein F  43.75 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  47.5 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  45 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.912377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  45 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0594  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  45 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2435  multiple resistance and pH regulation protein F  38.3 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.38947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  35.65 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35420  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  42.68 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.279201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  38.96 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  49.23 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3869  hypothetical protein  41.11 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  40.91 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  40.7 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0093627  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  30.68 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  40.48 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3656  hypothetical protein  36.67 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.5 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  30.77 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0498  multiple resistance and pH regulation protein F  38.38 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0212  multiple resistance and pH regulation protein F  46.67 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04213  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.25 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.49 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1445  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4626  multiple resistance and pH regulation protein F  41.67 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5210  hypothetical protein  34.52 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000708898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.57 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.14 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.88 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14790  Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)  37.5 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  28.57 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0042  multiple resistance and pH regulation protein F  38.2 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.53 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2927  multiple resistance and pH regulation protein F  34.18 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  0.611551 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  25.64 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  26.92 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  25.64 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  35 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.88 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0899  multiple resistance and pH regulation protein F  28 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.857013  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  27.5 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  31.51 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2932  multiple resistance and pH regulation protein F  37.88 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.65 
 
 		 117 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3621  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.99 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0308607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2656  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  26.39 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0996  pH adaption potassium efflux system, PhaF subunit  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  28.92 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.14 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  28.92 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>