42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  53.81 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  41.78 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  43.75 
 
 
220 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  41.98 
 
 
209 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  35.05 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  31.02 
 
 
262 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  34.94 
 
 
213 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  36.67 
 
 
217 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  33.49 
 
 
207 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  28.05 
 
 
214 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  33.03 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  31.75 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  33.72 
 
 
209 aa  92  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25.73 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  34.44 
 
 
457 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  30.86 
 
 
456 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.98 
 
 
500 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  30.49 
 
 
331 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  26.21 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3916  lipolytic protein G-D-S-L family  28.65 
 
 
281 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  26.21 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  26.09 
 
 
189 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  23.56 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  25.95 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  24.88 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  36.9 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.31 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  27.08 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.51 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  27.75 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.51 
 
 
286 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.2 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  36.54 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  27.67 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.06 
 
 
186 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1651  GDSL family lipase  25.15 
 
 
253 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  25.9 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  24.34 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>