More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1461 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1461  anthranilate synthase component II  100 
 
 
202 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1519  anthranilate synthase component II  98.02 
 
 
202 aa  410  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0790647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1527  anthranilate synthase component II  98.51 
 
 
202 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452213  normal  0.0147223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1663  anthranilate synthase component II  90.26 
 
 
200 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0146464  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2802  anthranilate synthase component II  90.26 
 
 
200 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2723  anthranilate synthase component II  90.26 
 
 
200 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2702  anthranilate synthase component II  89.74 
 
 
207 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2404  anthranilate synthase component II  89.18 
 
 
200 aa  360  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1428  anthranilate synthase component II  87.56 
 
 
211 aa  357  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3020  anthranilate synthase component II  91.58 
 
 
202 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2451  anthranilate synthase component II  84.82 
 
 
240 aa  337  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1589  anthranilate synthase component II  79.41 
 
 
204 aa  329  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1685  anthranilate synthase component II  77.61 
 
 
201 aa  321  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2913  anthranilate synthase component II  80.63 
 
 
201 aa  317  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970253  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2130  anthranilate synthase component II  79.58 
 
 
199 aa  309  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2252  anthranilate synthase component II  82.22 
 
 
202 aa  304  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3523  glutamine amido-transferase  58.03 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02759  anthranilate synthase component II  53.61 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2830  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  54.92 
 
 
226 aa  218  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2668  anthranilate synthase component II  56.68 
 
 
193 aa  218  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003087  anthranilate synthase amidotransferase component  54.12 
 
 
202 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2043  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
192 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1933  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
192 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2173  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
192 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1153  anthranilate synthase component II  55.9 
 
 
202 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02289  glutamine amido-transferase  54.59 
 
 
210 aa  208  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1933  anthranilate synthase component II  55.32 
 
 
192 aa  207  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  206  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
531 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 
531 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0795  anthranilate synthase component II  53.72 
 
 
203 aa  205  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2006  anthranilate synthase component II  55.08 
 
 
192 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2305  anthranilate synthase component II  55.08 
 
 
192 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1059  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.26 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.98 
 
 
197 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.15 
 
 
192 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  48.68 
 
 
187 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  48.68 
 
 
187 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  48.68 
 
 
187 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  48.68 
 
 
187 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.99 
 
 
192 aa  174  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  48.7 
 
 
192 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  46.91 
 
 
201 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  47.87 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  46.39 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.74 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  47.62 
 
 
187 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  47.09 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.21 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  49.21 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 
187 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  48.4 
 
 
187 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0158  anthranilate synthase component II  46.91 
 
 
194 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.965467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.48 
 
 
191 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  47.87 
 
 
187 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  46.84 
 
 
187 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  47.94 
 
 
192 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  43.88 
 
 
195 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  43.88 
 
 
195 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  43.88 
 
 
195 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  46.39 
 
 
197 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.15 
 
 
188 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  46.43 
 
 
195 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0180  anthranilate synthase component II  46.91 
 
 
194 aa  168  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.223965  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  46.28 
 
 
191 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3720  anthranilate synthase component II  46.91 
 
 
195 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  47.34 
 
 
187 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  47.15 
 
 
189 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.28 
 
 
188 aa  167  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  44.39 
 
 
195 aa  167  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  47.34 
 
 
188 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.88 
 
 
204 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  47.42 
 
 
238 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  47.87 
 
 
195 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.88 
 
 
193 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.84 
 
 
188 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  46.81 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  44.97 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  48.15 
 
 
190 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  46.91 
 
 
191 aa  165  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1850  anthranilate synthase component II  46.77 
 
 
193 aa  165  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  44.56 
 
 
199 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  45.03 
 
 
190 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>