23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3271 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  63.58 
 
 		 172 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  63.58 
 
 		 172 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  63.12 
 
 		 170 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  62.5 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  48.48 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  50.63 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  48.72 
 
 		 158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  46.2 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  44.52 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  44.16 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  42.04 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  41.88 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  42.31 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  38.96 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  39.61 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  27.85 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  25.17 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  28.99 
 
 		 527 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 586 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  28.31 
 
 		 525 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  25.49 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>