More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1613 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1613  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  100 
 
 
660 aa  1357    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.34161  normal  0.12882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1623  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.77 
 
 
663 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.735586  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4164  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.9 
 
 
575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 
651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.92 
 
 
549 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  33.86 
 
 
563 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  30.4 
 
 
564 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  33.86 
 
 
563 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  33.86 
 
 
539 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  33.86 
 
 
539 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  33.86 
 
 
539 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  33.86 
 
 
563 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  33.86 
 
 
539 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  29.49 
 
 
550 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 
552 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.83 
 
 
555 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 
552 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.18 
 
 
552 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  33.47 
 
 
560 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
555 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  34.29 
 
 
454 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.74 
 
 
627 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.47 
 
 
1054 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31 
 
 
724 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  30.11 
 
 
562 aa  90.9  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  29.74 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  29.66 
 
 
641 aa  89.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  29.18 
 
 
502 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.71 
 
 
498 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  27.82 
 
 
500 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  27.82 
 
 
497 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 
693 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.98 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 
1687 aa  84.7  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  27.3 
 
 
497 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  31.18 
 
 
576 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 
771 aa  83.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  32.73 
 
 
560 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.28 
 
 
617 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.47 
 
 
501 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  32 
 
 
688 aa  82  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.47 
 
 
638 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.98 
 
 
754 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.16 
 
 
579 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  28.11 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.82 
 
 
721 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.8 
 
 
587 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.75 
 
 
595 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.04 
 
 
636 aa  79  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1032  peptidase MprA  28.19 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 
648 aa  77.4  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 
797 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 
650 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
939 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.87 
 
 
653 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5741  serine protease, subtilase family  32.1 
 
 
564 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.66 
 
 
601 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 
520 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02673  extracellular protease  36.62 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.02 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.47 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.47 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  23.16 
 
 
620 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.31 
 
 
587 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
635 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
615 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 
597 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
682 aa  71.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3334  hypothetical protein  31.47 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261998  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.88 
 
 
587 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2890  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2484  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.36 
 
 
612 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.64 
 
 
625 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.49 
 
 
453 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1904  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.09 
 
 
548 aa  70.1  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0996  peptidase MprA  25.05 
 
 
540 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.74 
 
 
506 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 
852 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.02 
 
 
1361 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  31.62 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  27.23 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.04 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.55 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.18 
 
 
495 aa  67.4  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.24 
 
 
868 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  29.58 
 
 
1315 aa  67  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.17 
 
 
576 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.39 
 
 
699 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.13 
 
 
423 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  27.39 
 
 
586 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  26.92 
 
 
541 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
557 aa  65.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.46 
 
 
370 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0714  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.3 
 
 
683 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
742 aa  64.7  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.24 
 
 
882 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>