24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2646 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  86.82 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  82.17 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  74.22 
 
 		 128 aa  206  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  70.31 
 
 		 128 aa  199  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  74.05 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  66.67 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  73.21 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  73.21 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  73.21 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  75.89 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  27.55 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  28.41 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  28.87 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  26.58 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  24.74 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  31.94 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  31 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>